等再次回到公寓的时候,已经是月明星稀。
结束了一天的导游工作,陆时羡洗了个澡,倒下便睡。
当他再次清醒的时候,已经是上午九点。
这和他固有的生物钟是极不相符的,但也能看出他最近真的透支太多了。
这次倒是可以好好休息一下。
当他租住这间单人公寓的时候,是有设计一个书房的。
但现在看来,当时的设想似乎做了无用功,自从进了实验室,他都没有多少时间踏入其中。
单人公寓的作用仅仅只是一个宿舍而已。
乘着和煦的阳光,陆时羡兴起拿起一本《蚁丘》,从序言看到湖畔的初次探险。
即使原野一次次地被烧尽,蚁丘始终都会活下来,它向荒原提供营养,也向荒原上的新草讲述旧年的灾情。
爱德华·威尔逊是那种极少的文笔极好的生物学家,在他笔下构建了一个完全由蚂蚁构建的世界,揭示了一个微观世界中的生态系统和社会结构。
可惜,他的时间并不足以将这本书细细品味一遍,只是心中不断暗叹,果然能够开创一个学科的大佬所拥有的思想深度还是目前的他所不能触及的。
下午,陆时羡准时出现在实验室里。
而其余几人也陆陆续续地抵达,最后会和到一起。
看着梅林、瑟琳和鲍勃几人的精神状态好了许多,陆时羡点点头,开口说道:”大家应该都休息好了,现在是时候大干一场了。”
这个过程非常繁琐,特别是对植物基因组而言,因其包含有大量的基因和非编码区域,导致处理工作复杂。
陆时羡将目光投向三人:“怎么样?进行处理的详细步骤应该不用我说了吧,接下来我说一下初步安排。”
看着几人点点头,他继续说道:”第一步序列质量控制鲍勃你来,而第一步基因注释工作量也比较大,由我和梅林一起来做,瑟琳你来进行第三步的基因表达分析。”
“大家有没有问题?”
听到这几句话,三人都摇摇头。
事实上,他的安排是比较合理的。
没有人能保证在测序过程中不存在任何错误,哪怕只是一点误差就会对测序结果带来干扰。
然后连带着对后续数据分析与处理造成巨大的影响,因此对序列数据进行质量控制是减少误差影响的必要环节。
当然,这个工作对鲍勃而言并不难的,他的生物信息学课程掌握的还是比较扎实的,对序列比对、k-mer分析、gc含量分析等方法并并不陌生。
而基因注释是进行数据处理的关键环节,就如它字面上的意思一样,是对基因组序列中的基因和非编码序列进行识别和注释。
进行这个工作要么需要对比较基因组学具有比较熟悉的了解,通过已知物种中的基因和基因组结构相似性来找到植物基因组中的相似序列。
要么在实验数据处理上具有极高的水准,能够利用rna-seq和别的专业实验数据来确定基因位置和剪接模式。
两者工作过程看似截然不同,但最后殊途同归。
基因表达分析是用来评估植物基因组序列中的基因在不同的生长发育阶段或者是在不同环境条件下的表达级别。
可以运用差异表达分析、功能分析和通路分析等方法来帮助他们深入了解植物基因的功能和在它们在生长发育和环境响应中的作用机制。
处理基因测序信息数据的工作实际上是属于生物信息学的范畴。
其实目前生物信息学能够逐渐发展为一个独立的学科并不是没有道理的。
随着陆时羡所学所知的加深,他已经越来越能体会到万事万物都是互相联系的这句话。
也就是所谓的触类旁通,他能够运用哲学观念来思考来解释。
事物自身包含的矛盾存在于一切事物中,并且贯穿于事物发展过程的始终。
自从进入计算机时代,人们获取数据的速度得到了巨大的提升。。
但显然,数据并不等于信息。
一方面是每天进入embl、genbank和ddbj的数据每天都以指数式的数量来统计。而一方面是自然科学、生理学、医学等领域新知识产生的匮乏。
人们对新知识新信息产生缓慢落后的不满和飞速增长的数据速度形成了一个巨大的主要矛盾。
矛盾推动着事物的产生与发展,于是生物信息学在这种背景下产生并发展。
它的几个主要工作恰好对应着刚刚他所说的几个步骤。
序列比对和序列分析一个是对两个或两个以上符号序列进行相似性比较,一个是获知对应的基因和基因调控序列或对基因组中的基因和基因调控序列进行自动识别。
功能基因组的任务是进行基因组功能注释,了解基因的功能,认识基因与疾病的关系,掌握基因的产物及其在生命活动中的作用。
至于蛋白质结构预测则是生物信息学的重要应用,弄清蛋白质结构对于研究蛋白质的功能具有十分重要的作用。
近些年发展的比较快的应用是药物设计,即运用生物信息学的方法和手段对药物靶标基因进行发现和验证。m.xiumb.com
所以现在的生物学家,可以不会运用生物信息学方法,但他们绝对不能不懂生物信息学手段。
现在随着学科的边界不断泛化,没有人能够全知全能。
陆时羡其实一直认为,一个研究团队应当配置有主修生物信息学的人才。
当然,这是条件允许的情况,他还不具备这样奢侈的条件。
现在的处境就是,一个人他都恨不得扳成两个人用。
接下来的几天,所有人都沉浸在图谱和数字的世界。
而他们也终于收到了来自阶段性成果报告的组会。
关于这次组会,陆时羡并不慌,因为他们的任务早已经完成。
就是让鲍勃几人有些不忿的是辛苦完成的数据要转交给菲斯的小团队。
陆时羡倒是一如既往地淡定。 蓝星,夏国。
肿瘤科病房,弥漫着医院独有的消毒水味道。病房是单人间,设施俱全,温馨舒适。
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可对于孑然一身的路遥来讲,却是无人问津的等死之地。
他是癌症晚期,靠着意志力撑到现在,但也只是多受几天罪罢了。
此刻,路遥躺在病床上,怔怔望着床头柜上的水杯,想喝口水。
可他拼尽全力却无法让身体离开病床。剧痛和衰弱,让这原本无比简单的事情成了奢望。
这时,一道幸灾乐祸的声音响起:“表哥~你真是狼狈呢。连喝口水都得指望别人施舍。”
一位英俊的年轻男子悠闲坐在病床前,翘着二郎腿,眼睛笑成一道缝。
“你求求我,我给你喝口水如何?”
路遥面无表情,一言不发。自从失去了自理能力,一帮亲戚的嘴脸已经见多了,不差这一个。
男子起身,将水杯拿在手里递过来,“表哥别生气,我开玩笑的,你对我这么好,喂你口水还是能办到的。”
说完话,他将水杯里的水,缓缓倒在路遥苍白消瘦的脸上。
被呛到,路遥无力的咳嗽几声,好在少量的水流过嗓子,让他有了几丝说话的力气:
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“张鑫,为什么?我从未得罪过你。你去星盟国留学,还是我资助的!”
张鑫将水杯放下,不紧不慢的说:“谁让你这么古板呢,只是运点感冒药罢了,又不犯法,你非得千方百计的拦着。”
路遥脸上闪过一丝了然之色,道:“张鑫你这垃圾,狗改不了吃屎。将感冒药运到国外提炼毒品……咳咳……”
张鑫理了下领带,笑道:“你别血口喷人啊,我可是国际知名企业家。这次回国,‘省招商引资局’还打电话欢迎我呢~”
路遥叹了口气,现在的自己什么都做不了,索性闭上眼睛不再说话,安静等待死亡的到来。
但张鑫却不想让眼前饱受病痛折磨、即将离世的表兄走好。他附身靠近,悄悄说道:琇書蛧
“表哥啊~其实呢,我这次回国主要就是见你一面,告诉你一声——你的癌,是我弄出来的~”
路遥陡然挣开眼,“你说什么!”
张鑫笑眯眯的掏出个铅盒打开,里面是件古怪的三角形饰物,仅有巴掌大小,中间是只眼睛似的图案,一看就很有年代感。
“眼熟吧?这是我亲手送你的,货真价实的古董。我在里面掺了点放射性物质,长期接触就会变成你现在这副鬼样子。”
路遥马上认出来,这是自己很喜欢的一件古物,天天摆在书桌上,时不时的把玩,没想到却是要人命的东西!
他伸出枯枝似的手臂,死死的抓住眼前人的胳膊!“你……”
“别激动~表哥,我西装很贵的。”张鑫轻松拿掉路遥的手,小心的捏起铅盒,将放射性饰物塞进他怀里。
“我赶飞机,得先走一步。你好好留着这个当做纪念吧,有机会再去你的坟头蹦迪~”
说完话,张鑫从容起身离开。临走前,还回头俏皮的眨眨眼。他原本就男生女相,此时的神态动作居然有些娇媚。
保镖很有眼力劲,赶紧打开病房门。同时用无线耳麦联络同事,提前发动汽车。
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路遥只能无力的瘫在床上,浑身皆是钻心剜骨般的剧痛,还有无穷悔恨、不甘。
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但很快,剧痛渐渐消失,只剩麻木,路遥隐约听到过世的双亲在喊他。
就在路遥的身体越来越飘,即将失去意识时,胸口突然阵阵发烫,将他惊醒。
从怀中摸出那三角形饰物,发现这玩意变得滚烫无比,还在缓缓发光!
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