“说起来复杂,其实很简单,就是将大片的分成小片,然后完成测序后根据序列信息进行拼接。”
“而第三代测序技术则在前两种测序技术上又有了突破,无需进行pcr扩增,直接在单分子上进行测序。我之前所运用的smrt或nanopore技术就是基于边合成边测序的思想,通过四种荧光标记四种碱基,然后通过光的波长和峰值判断是何种碱基。”
说到这里,陆时羡已经简单把前三代的测序原理都简单介绍了一下。m.xiumb.com
他这当然不是在浪费时间,而是为了有的放矢,为后面的叙述进行铺垫。
“通过与水稻基因组相似性的比较过程中,我们发现如果这种新型禾本科植物的叶绿体基因功能非常出色,而叶绿体的功能大家都很清楚,是通过光合作用合成淀粉的场所,但在生长发育分化基因方面的功能却远不如水稻。”
“因此,我们小组有了一个设想,是不是能够通过第三代测序技术,将这种禾本科植物的高质量染色体水平基因组重新进行组装。通过夜以继日的努力,我们初步组装了1个2.12gb大小的染色体级别基因组,其中包含有12条伪染色体和29.098个编码蛋白质的基因。”
说到这里,很多人脸上已经变得有些莫名。
因为很多人意识到,不提陆时羡得到的实验结论,光凭这个实验方法就已经是一个极大的科研成果。
没错,在科学研究中,不仅仅只有实验结果可以发论文,一种可以被广泛使用的研究工具或者说方法也可以。
既然这种禾本科植物可以用三代测序技术进行重组,那我换成豆科、木兰科、蔷薇科,或者说直接改换成动物或者微生物,岂不是也能使用这个组装方法?
这一刻,几乎所有人眼前都仿佛看见论文在朝自己招手。
不过此时并没有到提问时间,所有人都在等着陆时羡说完。
“通过系统发育和比较基因组比较分析,发现这种植物与水稻分化后经历了一次全基因组复制。与此同时,我们鉴定了这种植物叶绿素四个阶段主要化合物以及它们的合成途径,发现了谷氨酸-1-半醛转氨酶(gsaat)基因的拷贝数大大增加......”
“最后,我还是想补充一句,根据我的判断,这种植物不是芦竹属,而是芒属。”
此言一出,热议又起。
不仅很多研究生对此发表了质疑,甚至也有教授们在窃窃私语。
“这也太离谱了吧?”
“如果是近属,我还能理解,但芦竹属与芒属的性状差的也太远了。”
“不知道,有没有可能是这位陆博士判断失误了?”
不过,这时曼伦老头出场了,他少有地笑眯眯看着此时闹腾腾的会议室,想到几天之前,他也是这种表情,不由得心生感叹。
“看来大家似乎有很多问题要问陆博士,既然这样,不如现在开始提问环节。”曼伦的这个提议得到所有人的认可,现场的秩序也得到有效控制。
很快,一位叫格威的副教授第一个站起来向陆时羡询问道:“请问你运用三代测序技术进行基因重组的方法具有普适性吗?”
相较于所谓的新物种之争,这个才是最为关键的问题,这位教授问的一针见血。
陆时羡也随之站起来表示敬意,用严谨但不显枯燥的话语说道:“就目前的情况而言,还存在一定的难度。”
就在所有人失望之际,却又听见他继续说道:“除非能够熟练掌握第三代测序技术操作。”
众人哪里想得到还有这种峰回路转,脸上重新泛起笑容来。
这是问题吗?
压根算不上。
操作而已,只要下得了功夫,总有熟练掌握的一天,对比于科学研究的未知性,这简直太良心了。
不过,陆时羡此时又出手降低了他们的期望值。
“经过这些天的尝试与观察,第三代测序技术对比于二代在测序读长和测序速度等方面有明显优势,但在成本和准确率方面还是有很大的缺憾。”
“如果pacbio能够在后续进行改进,我已经预感到学界对于全基因组的研究将迈入高速发展期。”
陆时羡的陈述非常中肯,既没有夸夸其词,也没有故作低沉。
格威副教授仍然非常满意的点点头:“谢谢你的解惑,虽然三代测序技术并非你创造,但关于这个技术上的应用,你已经走在所有人前面了。”
这已经是非常高的评价了,不过此时在所有人眼中看来是这么自然。
没办法,谁让技术刚出现,就连仪器制造者都还在不断摸索。
很多人甚至连操作都还没弄清楚,让他们去研究深层次的运用,那完全是不可能的事情。
此时,不提菲斯心情如何,站在他身后的欧文心里同样不太好受。
说实话,在内心他一直认为自己是要比陆时羡要强的。
自己已经是耶鲁大学的助理教授,而陆时羡还只是一个博士后研究员。
欧文死死盯着此时显得万众瞩目的陆时羡,心里不断盘旋着几个问题。
他为什么总有新成果拿出来?
他的进步为什么能这么快?
难道他真是个天才?
现在的欧文已经开始逐渐认清现实,因为他并没有道听途说,而是亲眼目睹陆时羡一步步在实验室里崭露头角。
他心里倒有些解脱了,这还有啥好说的,陆时羡的水平就是比自己要高,而且还在不断精进。
后面又回复了两位教授关于追问高质量基因重组的问题,终于有人问起了关于新物种的判断问题。
一位叫做路易斯的博士生终于按捺不住站起来问道:“陆博士,我曾经全文研究了新西兰大学关于这种禾本科植物在arxiv网站的研究成果,根据我们拿到的样本做性状判断,也完全符合他们的结论。”
“请问您是出于什么考虑做出这样的判断的呢?” 蓝星,夏国。
肿瘤科病房,弥漫着医院独有的消毒水味道。病房是单人间,设施俱全,温馨舒适。
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可对于孑然一身的路遥来讲,却是无人问津的等死之地。
他是癌症晚期,靠着意志力撑到现在,但也只是多受几天罪罢了。
此刻,路遥躺在病床上,怔怔望着床头柜上的水杯,想喝口水。
可他拼尽全力却无法让身体离开病床。剧痛和衰弱,让这原本无比简单的事情成了奢望。
这时,一道幸灾乐祸的声音响起:“表哥~你真是狼狈呢。连喝口水都得指望别人施舍。”
一位英俊的年轻男子悠闲坐在病床前,翘着二郎腿,眼睛笑成一道缝。
“你求求我,我给你喝口水如何?”
路遥面无表情,一言不发。自从失去了自理能力,一帮亲戚的嘴脸已经见多了,不差这一个。
男子起身,将水杯拿在手里递过来,“表哥别生气,我开玩笑的,你对我这么好,喂你口水还是能办到的。”
说完话,他将水杯里的水,缓缓倒在路遥苍白消瘦的脸上。
被呛到,路遥无力的咳嗽几声,好在少量的水流过嗓子,让他有了几丝说话的力气:
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“张鑫,为什么?我从未得罪过你。你去星盟国留学,还是我资助的!”
张鑫将水杯放下,不紧不慢的说:“谁让你这么古板呢,只是运点感冒药罢了,又不犯法,你非得千方百计的拦着。”
路遥脸上闪过一丝了然之色,道:“张鑫你这垃圾,狗改不了吃屎。将感冒药运到国外提炼毒品……咳咳……”
张鑫理了下领带,笑道:“你别血口喷人啊,我可是国际知名企业家。这次回国,‘省招商引资局’还打电话欢迎我呢~”
路遥叹了口气,现在的自己什么都做不了,索性闭上眼睛不再说话,安静等待死亡的到来。
但张鑫却不想让眼前饱受病痛折磨、即将离世的表兄走好。他附身靠近,悄悄说道:琇書蛧
“表哥啊~其实呢,我这次回国主要就是见你一面,告诉你一声——你的癌,是我弄出来的~”
路遥陡然挣开眼,“你说什么!”
张鑫笑眯眯的掏出个铅盒打开,里面是件古怪的三角形饰物,仅有巴掌大小,中间是只眼睛似的图案,一看就很有年代感。
“眼熟吧?这是我亲手送你的,货真价实的古董。我在里面掺了点放射性物质,长期接触就会变成你现在这副鬼样子。”
路遥马上认出来,这是自己很喜欢的一件古物,天天摆在书桌上,时不时的把玩,没想到却是要人命的东西!
他伸出枯枝似的手臂,死死的抓住眼前人的胳膊!“你……”
“别激动~表哥,我西装很贵的。”张鑫轻松拿掉路遥的手,小心的捏起铅盒,将放射性饰物塞进他怀里。
“我赶飞机,得先走一步。你好好留着这个当做纪念吧,有机会再去你的坟头蹦迪~”
说完话,张鑫从容起身离开。临走前,还回头俏皮的眨眨眼。他原本就男生女相,此时的神态动作居然有些娇媚。
保镖很有眼力劲,赶紧打开病房门。同时用无线耳麦联络同事,提前发动汽车。
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路遥只能无力的瘫在床上,浑身皆是钻心剜骨般的剧痛,还有无穷悔恨、不甘。
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但很快,剧痛渐渐消失,只剩麻木,路遥隐约听到过世的双亲在喊他。
就在路遥的身体越来越飘,即将失去意识时,胸口突然阵阵发烫,将他惊醒。
从怀中摸出那三角形饰物,发现这玩意变得滚烫无比,还在缓缓发光!
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