进入支线剧情的人数有限制，所以风眠公会只是派出了星光和风澜两支小队，铁雄公会派出一支小队。奥古三支小队。地球联邦军玩家出动了四支小队。
这个支线剧情的主力是地球联邦军的新机体msa-0011s高达，其他的机体都是为他做配。s高达重新启用了元祖高达的组合机体设计理念，全身由三部分组成。
s高达的上半身，为战斗攻击机，在宇宙或者大气圈内都拥有绝佳的运动性，背包装备2门大口径光束加农炮，无论是ms形态还是g-attacker形态都可以使用。双翼还载有推进剂槽。www.xiumb.com
s高达的下半身，为爆击机，拥有强猛的火力以及不俗的续航能力，大腿部的光束加农炮是从msz-006a1zplus·a1型所使用的光束加农炮改良而来，可进行广范围的射击。还可在机体右侧选装高出力的精灵光束炮以代替光束加农炮，机体左侧替换光束加农炮的则是能量补充器。
中心部位用核心战机连接，核心战机跟元祖高达的的核心部件设计相似，标准武装是导弹发射架，就算单独作为一台战斗机也没有任何问题，足以保证机师的逃生以及战斗数据的回收。
头部由于搭载了准塞可缪兵器，有线制御炮系统以及四门火神炮，为了达到及时散热的目的，在头部加装了强力的冷却装置以及大量的散热片确保散热。这也就是机体的脸颊有着类似鱼鳃状物体的原因。
而该机的最大特点就是机体内还暗藏了自我学习型电脑——“爱丽丝”即a.l.i.c.e.system——advancedlogisticin-consequencecognizingequipment——“发展型逻辑/非逻辑辨识装置”，这是一部拥有女性人格的超级电脑。也就是智能ai
爱丽丝具有独立人格，能够独立思考、分析，在作战中甚至可以独立控制ms，因此比以往只是辅助用的“学习型电脑”更先进。而“爱丽丝”其能力在与机师的“恋爱”过程中将不断得到增长，因此，机师的人选是以思维方式超越逻辑和常识的“危险分子”为佳。
由于爱丽丝具有真正的人工智能，能够学习理解人类的感情、判断是非，而不是一味的遵从人类的命令，因此联邦的高层们担心这样的技术会拒绝下达的某些“没有道义”的命令，不符合联邦高层的利益，因此导致爱丽丝并不受重视，随着搭载爱丽丝的s高达的损毁，这项伟大的计划也就此终止。
驾驶这台先进机体的机师是獠·鲁兹，地球联邦军少尉机师。其父亲在一年战争期间身亡，母亲则是开发“爱丽丝系统”的科学家，也在开发期间死亡，因此造成了獠叛逆的性格。
除了主角之外，其他的工作都由玩家承担，战舰也是统一的麦哲伦改级战列舰。阿尔法小队集结了三艘战舰向着培曾基地开进。铁雄公会的小队和奥古的小队被留在月球，充当月球守卫队。
此时的培曾基地盘踞着五支隶属于新迪赛斯的小队，外部还有叛变过来的埃诺舰队帮忙，还有悄然而至新吉翁的协助，战力上不虚阿尔法小队。
第一幕是培曾基地的新迪赛斯玩家发动叛乱，用新机体rms-141赛克·艾恩轻松击溃了用rms-154巴扎姆改良型搭建第一道防御线的地球联邦军的npc。顺利夺过培曾基地的控制权。
第二幕是已经控制了培曾基地的新迪赛斯玩家出动和埃诺舰队汇合，打算进入月面都市艾尔斯。艾尔斯市是一座坐落于月球南部的自治都市，由于月球轨道运行的原因，这座都市永远不会面向地球，由于这个原因和其他历史因素，使得这座城市的居民对地球产生了一种奇异的邪教般的崇拜，这种崇拜使他们成为泰坦斯的主要支持者，以至于在格利普斯战争结束时，包括市长凯撒·派恩菲尔德在内的艾尔斯市民兵出动保卫格利普斯2号。
格利普斯战争之后，培曾教导团发动叛乱，组建新迪赛斯，艾尔斯市又支持叛乱者，将这座城市作为新迪赛斯的后方要塞，于u.c.0088年3月12日接纳新迪赛斯军队入驻。
虽然艾尔斯市已经接纳了新迪赛斯，但是隶属于地球联邦的月面防卫队不能答应这种行为。于是二者展开了激烈战斗。此时和主角一同出发的阿尔法小队，也是一同赶往艾尔斯市救援。
坚守艾尔斯市的玩家，使用的机体是rgm-86r努贝尔·吉姆Ⅲ和msa-007耐罗。还有3台稀有机体fa-010-a全装甲zz高达先行量产试作型。
机体的性能很是不错，但是人数差距过大导致艾尔斯市落入了新迪赛斯之手，但是机体的到了最大限度的保存。
原著中战斗持续了很久，但是剧情里的战斗，在阿尔法小队到达后，战斗就结束了。楼宇等人跑了一路，但是在第一幕和第二幕都没有出手的机会。
直到第三幕，地球联邦军发动“鹰坠行动”。开始攻击艾尔斯市，楼宇等人才得以登场。 蓝星，夏国。
肿瘤科病房，弥漫着医院独有的消毒水味道。病房是单人间，设施俱全，温馨舒适。
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可对于孑然一身的路遥来讲，却是无人问津的等死之地。
他是癌症晚期，靠着意志力撑到现在，但也只是多受几天罪罢了。
此刻，路遥躺在病床上，怔怔望着床头柜上的水杯，想喝口水。
可他拼尽全力却无法让身体离开病床。剧痛和衰弱，让这原本无比简单的事情成了奢望。
这时，一道幸灾乐祸的声音响起：“表哥~你真是狼狈呢。连喝口水都得指望别人施舍。”
一位英俊的年轻男子悠闲坐在病床前，翘着二郎腿，眼睛笑成一道缝。
“你求求我，我给你喝口水如何？”
路遥面无表情，一言不发。自从失去了自理能力，一帮亲戚的嘴脸已经见多了，不差这一个。
男子起身，将水杯拿在手里递过来，“表哥别生气，我开玩笑的，你对我这么好，喂你口水还是能办到的。”
说完话，他将水杯里的水，缓缓倒在路遥苍白消瘦的脸上。
被呛到，路遥无力的咳嗽几声，好在少量的水流过嗓子，让他有了几丝说话的力气：
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“张鑫，为什么？我从未得罪过你。你去星盟国留学，还是我资助的！”
张鑫将水杯放下，不紧不慢的说：“谁让你这么古板呢，只是运点感冒药罢了，又不犯法，你非得千方百计的拦着。”
路遥脸上闪过一丝了然之色，道：“张鑫你这垃圾，狗改不了吃屎。将感冒药运到国外提炼毒品……咳咳……”
张鑫理了下领带，笑道：“你别血口喷人啊，我可是国际知名企业家。这次回国，‘省招商引资局’还打电话欢迎我呢~”
路遥叹了口气，现在的自己什么都做不了，索性闭上眼睛不再说话，安静等待死亡的到来。
但张鑫却不想让眼前饱受病痛折磨、即将离世的表兄走好。他附身靠近，悄悄说道：琇書蛧
“表哥啊~其实呢，我这次回国主要就是见你一面，告诉你一声——你的癌，是我弄出来的~”
路遥陡然挣开眼，“你说什么！”
张鑫笑眯眯的掏出个铅盒打开，里面是件古怪的三角形饰物，仅有巴掌大小，中间是只眼睛似的图案，一看就很有年代感。
“眼熟吧？这是我亲手送你的，货真价实的古董。我在里面掺了点放射性物质，长期接触就会变成你现在这副鬼样子。”
路遥马上认出来，这是自己很喜欢的一件古物，天天摆在书桌上，时不时的把玩，没想到却是要人命的东西！
他伸出枯枝似的手臂，死死的抓住眼前人的胳膊！“你……”
“别激动~表哥，我西装很贵的。”张鑫轻松拿掉路遥的手，小心的捏起铅盒，将放射性饰物塞进他怀里。
“我赶飞机，得先走一步。你好好留着这个当做纪念吧，有机会再去你的坟头蹦迪~”
说完话，张鑫从容起身离开。临走前，还回头俏皮的眨眨眼。他原本就男生女相，此时的神态动作居然有些娇媚。
保镖很有眼力劲，赶紧打开病房门。同时用无线耳麦联络同事，提前发动汽车。
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路遥只能无力的瘫在床上，浑身皆是钻心剜骨般的剧痛，还有无穷悔恨、不甘。
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但很快，剧痛渐渐消失，只剩麻木，路遥隐约听到过世的双亲在喊他。
就在路遥的身体越来越飘，即将失去意识时，胸口突然阵阵发烫，将他惊醒。
从怀中摸出那三角形饰物，发现这玩意变得滚烫无比，还在缓缓发光！
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